Podwodny raj, Pepperland, zostaje zaatakowany przez nienawidzących muzyki Sinych Smutasów. Ostatni ocalały mieszkaniec krainy, Stary Fred, wyrusza żółtą łodzią podwodną w poszukiwaniu pomocy, którą znajduje u czwórki muzyków - Beatlesów. Zespół wraz z nowym przyjacielem, Jeremym, przebywa długą drogę, przeżywając liczne przygody.