Mieszkająca na polu mysz Pani Brisby jest wdową po Jonathanie, bohaterskiej myszy która pomogła uciec wielu szczurom i myszom z laboratorium NIMH. Nadchodzące zbiory zmuszają panią Brisby do przeprowadzki. Przeszkodą w tym planie jest jej bardzo chory synek, cierpiący na zapalenie płuc, który mógły nie przeżyć tak forsownej przeprowadzki. Zdesperowana mysz z pomocą gapowatego kruka Jeremiasza (Jeremy) zasięga pomocy u Wielkiej Sowy. Radzi ona by przenieść jej dom na zawietrzna stronę kamienia, a pomóc jej w tym maja szczury, niegdyś zbiegłe z NIMH. Pani Brisby będzie musiała pokonać wiele trudności w tym nie przychylnego jej szczura Jennera oraz kota Dragona.