Styczeń 1999: Azaka Kokutou, młodsza siostra Mikiya'i, został poproszona przez swojego mentora, Touko Aozaki, o zbadane pewnego incydentu w Akademii Reien, szkole do której sama uczęszcza. W sprawę tą zamieszane są wróżki kradnące wspomnienia uczniów, które dotyczą niedawno mającej tam miejsce tragedii. Azaka rozpoczyna dochodzenie wraz z wysłaną jej do pomocy Shiki.